Estudio arroja más luz sobre los interruptores de encendido y apagado de los genes
Científicos de la Universidad de Michigan están utilizando métodos computacionales para investigar cómo la variación genética en el ADN no codificante puede aumentar la susceptibilidad de una persona a ciertas enfermedades, como la diabetes y el cáncer. Para ello están comparando cinco tipos de regiones reguladoras identificadas en los últimos años para ver cómo se comportan en diferentes tipos de células.
Además, los investigadores han descubierto recientemente que las variantes genéticas asociadas a enfermedades tienden a residir en áreas del genoma que actúan como potenciadores y promotores. Concretamente, su investigación se ha centrado en comparar esta clase de elementos reguladores, descubriendo que todos son diferentes y que actúan de distinta forma en diferentes tipos celulares.
Sin embargo, también descubrieron que las variantes genéticas de los potenciadores específicos de cada tipo celular tienen ligeros efectos en sus genes objetivo, lo que podría suponer un problema cuando se comparan los genomas de miles de personas para tratar de localizar la variación genética asociada con los rasgos de la enfermedad. De esta forma, para ver los efectos se van a necesitar tamaños de muestra realmente grandes.
Por último, sugieren que los potenciadores y promotores que son específicos de un tipo celular podrían facilitar la transcripción en ciertas condiciones ambientales al hacer que la cromatina sea más accesible.
Link
https://labblog.uofmhealth.org/lab-report/study-sheds-more-light-on-genes-onoff-switches.
Referencia
Genetics. 2019 Feb;211(2):549-562. doi: 10.1534/genetics.118.301525. Epub 2018 Dec 28. Cell Specificity of Human Regulatory Annotations and Their Genetic Effects on Gene Expression. Varshney A, VanRenterghem H, Orchard P, Boyle AP, Stitzel ML, Ucar D, Parker SCJ.
By Eduardo Diego Lozano Escobar (DGMol)
Científicos de la Universidad de Michigan están utilizando métodos computacionales para investigar cómo la variación genética en el ADN no codificante puede aumentar la susceptibilidad de una persona a ciertas enfermedades, como la diabetes y el cáncer. Para ello están comparando cinco tipos de regiones reguladoras identificadas en los últimos años para ver cómo se comportan en diferentes tipos de células.
Además, los investigadores han descubierto recientemente que las variantes genéticas asociadas a enfermedades tienden a residir en áreas del genoma que actúan como potenciadores y promotores. Concretamente, su investigación se ha centrado en comparar esta clase de elementos reguladores, descubriendo que todos son diferentes y que actúan de distinta forma en diferentes tipos celulares.Sin embargo, también descubrieron que las variantes genéticas de los potenciadores específicos de cada tipo celular tienen ligeros efectos en sus genes objetivo, lo que podría suponer un problema cuando se comparan los genomas de miles de personas para tratar de localizar la variación genética asociada con los rasgos de la enfermedad. De esta forma, para ver los efectos se van a necesitar tamaños de muestra realmente grandes.
Por último, sugieren que los potenciadores y promotores que son específicos de un tipo celular podrían facilitar la transcripción en ciertas condiciones ambientales al hacer que la cromatina sea más accesible.
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https://labblog.uofmhealth.org/lab-report/study-sheds-more-light-on-genes-onoff-switches.
Referencia
Genetics. 2019 Feb;211(2):549-562. doi: 10.1534/genetics.118.301525. Epub 2018 Dec 28. Cell Specificity of Human Regulatory Annotations and Their Genetic Effects on Gene Expression. Varshney A, VanRenterghem H, Orchard P, Boyle AP, Stitzel ML, Ucar D, Parker SCJ.
By Eduardo Diego Lozano Escobar (DGMol)
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