Crean una herramienta que
podría dar un paso más en la edición del genoma: CRISPETa
Un equipo internacional de científicos ha
creado una herramienta que podría permitir dar un paso más en la edición del
genoma. Se trata de un software que servirá para estudiar mejor el ADN no
codificante y que, por tanto, puede acelerar las investigaciones sobre el
origen genético de muchas enfermedades y ayudar a desarrollar nuevos
medicamentos.
El estudio, publicado en PLOS
Computational Biology, ha sido realizado por investigadores del Centro de
Regulación Genómica (CRG), de la Universidad Pompeu Fabra de Barcelona (UPF), y
del Instituto Hospital del Mar de Investigaciones Médicas (IMIM), en
colaboración con científicos de varias instituciones suizas.
El exoma -hasta ahora lo mejor estudiado- es
la parte codificante del DNA, pero es también donde tienen lugar la mayoría de
las mutaciones que causan enfermedades. El 98% restante del genoma se
consideraba carente de función; sin embargo, los científicos han comprobado mediante
secuenciación masiva y edición genética, que estos genes regulan importantes
procesos celulares y están alterados en muchas enfermedades.
En 2015, el grupo liderado por Rory Johnson,
diseñó una herramienta basada en CRISPR-Cas9, bautizada “Decko”, que permitía
utilizar la técnica de edición genómica en el ADN basura, ampliando su uso a
todo el genoma. A partir de Decko nace CRISPETa, un software que diseña parejas
de sgRNA guías, lo que permitirá hacer un doble corte en el genoma y eliminar
una parte de un gen, cambiando su función reguladora. La gran ventaja de la nueva
herramienta es que puede trabajar con varios genes en paralelo. De esta forma lograríamos
hacer experimentos a gran escala, consiguiendo modificar células y organismos,
así como encontrar nuevos tratamientos.
Referencia
Pulido-Quetglas C, Aparicio-Prat E, Arnan C,
Polidori T, Hermoso T, Palumbo E, et al. (2017) Scalable Design of Paired
CRISPR Guide RNAs for Genomic Deletion. PLoS Comput Biol 13(3): e1005341.
doi:10.1371/journal.pcbi.1005341
By Laura Díaz Regalado (GMed)
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