PROYECTO
DE SECUENCIACIÓN DE 10.000 GENOMAS
PARA CONOCER MUTACIONES EN EL CANCER
Investigadores del cáncer han recopilado
durante 7 años mutaciones en tumores de pacientes. Durante esta semana, los
investigadores del Instituto Nacional del Cáncer (NCI), han dado a conocer un
proyecto: un amplio estudio de más de 10.000 tumores diferentes y el objetivo
es intentar identificar los genes
del cancer. El próximo año, el NCI va a acabar el Atlas
del Genoma del Cáncer (TCGA), un gran proyecto piloto de 2006, que es
sistemáticamente buscando tumores para los cambios genéticos implicados en el
cáncer. Más de 150 investigadores del cáncer han repartido el trabajo de
secuenciación de 500 muestras de tumores para unos 20 tipos de cáncer (10.000
muestras en total). TCGA ha confirmado genes conocidos de cáncer y
encontró nuevos cambios genéticos. Louis Staudt (genetistas) explicó que debido a
que los tumores presentan mutaciones que no están implicadas en el cáncer, es
difícil seleccionar. Por ellos se requieren muchos ejemplos de secuencias. Louis Staudt luego describió lo que llamó
"El concepto 10K". La idea es 10.000 secuencia de muestras de
tumores para cada uno de varios cánceres comunes, tales como el de mama y de
próstata. Esto debería ser suficiente para encontrar las mutaciones que se
producen en tan sólo un 1% de las muestras. Y se intentará relacionar los
resultados genético con el resultado clínico y factores de estilo de vida. Encontrar los 10.000 tumores es difícil por
ellos, usaron las biopsias conservadas en parafina, y después se secuenciaron y
se usaron para estudios de expresión génica. También se usaron recopilaciones
de muestras de tumores de ensayos clínicos y estudios observacionales.
Investigadores del cáncer han recopilado
durante 7 años mutaciones en tumores de pacientes. Durante esta semana, los
investigadores del Instituto Nacional del Cáncer (NCI), han dado a conocer un
proyecto: un amplio estudio de más de 10.000 tumores diferentes y el objetivo
es intentar identificar los genes
del cancer. El próximo año, el NCI va a acabar el Atlas
del Genoma del Cáncer (TCGA), un gran proyecto piloto de 2006, que es
sistemáticamente buscando tumores para los cambios genéticos implicados en el
cáncer. Más de 150 investigadores del cáncer han repartido el trabajo de
secuenciación de 500 muestras de tumores para unos 20 tipos de cáncer (10.000
muestras en total). TCGA ha confirmado genes conocidos de cáncer y
encontró nuevos cambios genéticos. Louis Staudt (genetistas) explicó que debido a
que los tumores presentan mutaciones que no están implicadas en el cáncer, es
difícil seleccionar. Por ellos se requieren muchos ejemplos de secuencias. Louis Staudt luego describió lo que llamó
"El concepto 10K". La idea es 10.000 secuencia de muestras de
tumores para cada uno de varios cánceres comunes, tales como el de mama y de
próstata. Esto debería ser suficiente para encontrar las mutaciones que se
producen en tan sólo un 1% de las muestras. Y se intentará relacionar los
resultados genético con el resultado clínico y factores de estilo de vida. Encontrar los 10.000 tumores es difícil por
ellos, usaron las biopsias conservadas en parafina, y después se secuenciaron y
se usaron para estudios de expresión génica. También se usaron recopilaciones
de muestras de tumores de ensayos clínicos y estudios observacionales.
by Javier Ramírez Bravo
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