La expresión de los genes puede determinar la hora de la
muerte
Tras la muerte de un
individuo, muchos de sus genes cambian su expresión de una forma diferente en
los distintos tejidos. Un equipo internacional de científicos liderado por
Roderic Guigó, del Centro de Regulación Genómica de Barcelona, afirma que estos
cambios podrían utilizarse para determinar, con una precisión considerable, el
intervalo post mortem (el tiempo
transcurrido tras la muerte).
Tras la
muerte, se produce una situación de isquemia en el individuo, es decir, al
detenerse el corazón deja de llegar sangre oxigenada a las células. Esta
situación de isquemia provoca la activación de cascadas que culminan con la
autolisis de la célula. Por tanto, para emplear el transcriptoma de la célula
como base para determinar el intervalo post
mortem (PMI), es necesario distinguir entre los genes cuya expresión varía
debido a la muerte (por lo que sus niveles de expresión van a depender del PMI)
y aquellos genes cuyos patrones de expresión se ven alterados por las
circunstancias en las que se ha producido la muerte (u otras variables).
Los genes cuya expresión
cambia dependiendo del PMI han sido identificados gracias a muestras tomadas
por el proyecto GTEx, que aspira a crear una base de datos de referencia y un
banco de tejidos para que los científicos estudien la susceptibilidad por una
enfermedad. Para ello han tomado muestras de diferentes individuos y de
distintos tejidos de los mismos, conociéndose el PMI de cada una de ellas. En
el estudio se emplearon 7105 muestras pertenecientes a 570 individuos del
proyecto GTEx, restringiendo el análisis a 36 tejidos diferentes.
Una vez identificados dichos
genes y, teniendo en cuenta una serie de variables diferentes al PMI (por
ejemplo, que la expresión de un mismo gen en dos tejidos diferentes no varía de
la misma manera tras la muerte) se puede diseñar un software que, introduciendo
los datos de los niveles de expresión en distintos tejidos de un individuo
fallecido (esto se consigue, por ejemplo, extrayendo el RNA y llevando a cabo
una PCR cuantitativa), proporcione una predicción de la hora de la muerte.
Revista
Referencia bibliográfica
Ferreira G. Pedro, et al. “The effects of death and
post-mortem cold ischemia on human tissue transcriptomes” Nature Communications
(2018) 9:490. DOI: 10.1038/s41467-017-02772-x
By Angel Ruíz (DGMol)
